TY - JOUR AU - Bellegarde, F. AU - Maghiaoui, A. AU - Boucherez, J. AU - Krouk, G. AU - Lejay, L. AU - Bach, L. AU - Gojon, A. AU - Martin, A. PY - 2019 DA - 2019// TI - The chromatin factor HNI9 and ELONGATED HYPOCOTYL5 maintain ROS homeostasis under high nitrogen provision JO - Plant Physiol VL - 180 UR - https://doi.org/10.1104/pp.18.01473 DO - 10.1104/pp.18.01473 ID - Bellegarde2019 ER - TY - JOUR AU - Cai, H. AU - Lu, Y. AU - Xie, W. AU - Zhu, T. AU - Lian, X. PY - 2012 DA - 2012// TI - Transcriptome response to nitrogen starvation in rice JO - J Biosci VL - 37 UR - https://doi.org/10.1007/s12038-012-9242-2 DO - 10.1007/s12038-012-9242-2 ID - Cai2012 ER - TY - JOUR AU - Chinpongpanich, A. AU - Limruengroj, K. AU - Phean-o-pas, S. AU - Limpaseni, T. AU - Buaboocha, T. PY - 2012 DA - 2012// TI - Expression analysis of calmodulin and calmodulin-like genes from rice, Oryza sativa L JO - BMC Res Notes VL - 5 UR - https://doi.org/10.1186/1756-0500-5-625 DO - 10.1186/1756-0500-5-625 ID - Chinpongpanich2012 ER - TY - JOUR AU - Curci, P. L. AU - Cigliano, R. A. AU - Zuluaga, D. L. AU - Janni, M. AU - Sanseverino, W. AU - Sonnante, G. PY - 2017 DA - 2017// TI - Transcriptomic response of durum wheat to nitrogen starvation JO - Sci Rep VL - 7 UR - https://doi.org/10.1038/s41598-017-01377-0 DO - 10.1038/s41598-017-01377-0 ID - Curci2017 ER - TY - JOUR AU - Foster, C. E. AU - Martin, T. M. AU - Pauly, M. PY - 2010 DA - 2010// TI - Comprehensive compositional analysis of plant cell walls (lignocellulosic biomass) part I: lignin JO - J Vis Exp VL - 37 ID - Foster2010 ER - TY - JOUR AU - Francisco, R. H. AU - Shane, M. W. AU - López-Bucio, J. PY - 2015 DA - 2015// TI - Nutritional regulation of root development JO - Wiley Interdiscip Rev Dev Biol VL - 4 UR - https://doi.org/10.1002/wdev.183 DO - 10.1002/wdev.183 ID - Francisco2015 ER - TY - JOUR AU - Godfray, H. C. AU - Beddington, J. R. AU - Crute, I. R. AU - Haddad, L. AU - Lawrence, D. AU - Muir, J. F. AU - Pretty, J. AU - Robinson, S. AU - Thomas, S. M. AU - Toulmin, C. PY - 2010 DA - 2010// TI - Food security: the challenge of feeding 9 billion people JO - Science VL - 327 UR - https://doi.org/10.1126/science.1185383 DO - 10.1126/science.1185383 ID - Godfray2010 ER - TY - JOUR AU - Gutiérrez, R. A. PY - 2012 DA - 2012// TI - Systems biology for enhanced plant nitrogen nutrition JO - Science VL - 336 UR - https://doi.org/10.1126/science.1217620 DO - 10.1126/science.1217620 ID - Gutiérrez2012 ER - TY - JOUR AU - Hakeem, K. R. AU - Ahmad, A. AU - Iqbal, M. AU - Gucel, S. AU - Ozturk, M. PY - 2011 DA - 2011// TI - Nitrogen-efficient rice cultivars can reduce nitrate pollution JO - Environ Sci Pollut Res VL - 18 UR - https://doi.org/10.1007/s11356-010-0434-8 DO - 10.1007/s11356-010-0434-8 ID - Hakeem2011 ER - TY - JOUR AU - Hao, J. AU - Guo, H. AU - Shi, X. N. AU - Wang, Y. AU - Wan, Q. H. AU - Song, Y. B. AU - Zhang, L. AU - Dong, M. AU - Shen, C. J. PY - 2017 DA - 2017// TI - Comparative proteomic analyses of two Taxus species (Taxus × media and Taxus mairei) reveals variations in the metabolisms associated with paclitaxel and other metabolites JO - Plant Cell Physiol VL - 58 UR - https://doi.org/10.1093/pcp/pcx128 DO - 10.1093/pcp/pcx128 ID - Hao2017 ER - TY - JOUR AU - Hua, L. AU - Wang, D. R. AU - Tan, L. B. AU - Fu, Y. C. AU - Liu, F. X. AU - Xiao, L. T. AU - Zhu, Z. F. AU - Fu, Q. AU - Sun, X. Y. AU - Gu, P. AU - Cai, H. W. AU - McCouch, S. R. AU - Sun, C. Q. PY - 2015 DA - 2015// TI - LABA1, a domestication gene associated with long, barbed awns in wild rice JO - Plant Cell VL - 27 UR - https://doi.org/10.1105/tpc.15.00260 DO - 10.1105/tpc.15.00260 ID - Hua2015 ER - TY - JOUR AU - Ju, C. AU - Buresh, R. J. AU - Wang, Z. AU - Zhang, H. AU - Liu, L. AU - Yang, J. AU - Zhang, J. PY - 2015 DA - 2015// TI - Root and shoot traits for rice varieties with higher grain yield and higher nitrogen use efficiency at lower nitrogen rates application JO - Field Crop Res VL - 175 UR - https://doi.org/10.1016/j.fcr.2015.02.007 DO - 10.1016/j.fcr.2015.02.007 ID - Ju2015 ER - TY - JOUR AU - Lee, D. AU - Polisensky, D. H. AU - Braam, J. PY - 2005 DA - 2005// TI - Genome-wide identification of touch- and darkness-regulated Arabidopsis genes: a focus on calmodulin-like and XTH genes JO - New Phytol VL - 165 UR - https://doi.org/10.1111/j.1469-8137.2004.01238.x DO - 10.1111/j.1469-8137.2004.01238.x ID - Lee2005 ER - TY - JOUR AU - Lescano, C. I. AU - Martini, C. AU - González, C. A. AU - Desimone, M. PY - 2016 DA - 2016// TI - Allantoin accumulation mediated by allantoinase downregulation and ransport by ureide permease 5 confers salt stress tolerance to Arabidopsis plants JO - Plant Mol Biol VL - 91 UR - https://doi.org/10.1007/s11103-016-0490-7 DO - 10.1007/s11103-016-0490-7 ID - Lescano2016 ER - TY - JOUR AU - Li, Y. AU - Yang, X. AU - Ren, B. AU - Shen, Q. AU - Guo, S. PY - 2012 DA - 2012// TI - Why nitrogen use efficiency decreases under high nitrogen supply in rice (Oryza sativa L.) seedlings JO - J Plant Growth Regul VL - 31 UR - https://doi.org/10.1007/s00344-011-9218-8 DO - 10.1007/s00344-011-9218-8 ID - Li2012 ER - TY - JOUR AU - Liu, X. AU - Zhang, Y. AU - Han, W. AU - Tang, A. AU - Shen, J. AU - Cui, Z. AU - Vitousek, P. AU - Erisman, J. W. AU - Coulding, K. AU - Christie, P. AU - Fangmeier, A. AU - Zhang, F. PY - 2013 DA - 2013// TI - Enhanced nitrogen deposition over China JO - Nature VL - 494 UR - https://doi.org/10.1038/nature11917 DO - 10.1038/nature11917 ID - Liu2013 ER - TY - JOUR AU - Luo, J. AU - Zhou, J. AU - Li, H. AU - Shi, W. AU - Polle, A. AU - Lu, M. AU - Sun, X. AU - Luo, Z. B. PY - 2015 DA - 2015// TI - Global poplar root and leaf transcriptomes reveal links between growth and stress responses under nitrogen starvation and excess JO - Tree Physiol VL - 35 UR - https://doi.org/10.1093/treephys/tpv091 DO - 10.1093/treephys/tpv091 ID - Luo2015 ER - TY - JOUR AU - Lynch, J. P. PY - 2013 DA - 2013// TI - Steep, cheap and deep: an ideotype to optimize water and N acquisition by maize root systems JO - Ann Bot VL - 112 UR - https://doi.org/10.1093/aob/mcs293 DO - 10.1093/aob/mcs293 ID - Lynch2013 ER - TY - BOOK AU - Marschner, H. PY - 1995 DA - 1995// TI - Mineral nutrition of higher plants PB - Academic CY - London ID - Marschner1995 ER - TY - JOUR AU - Meng, F. AU - Xiang, D. AU - Zhu, J. AU - Li, Y. AU - Mao, C. PY - 2019 DA - 2019// TI - Molecular mechanisms of root development in Rice JO - Rice VL - 12 UR - https://doi.org/10.1186/s12284-018-0262-x DO - 10.1186/s12284-018-0262-x ID - Meng2019 ER - TY - JOUR AU - Mi, G. H. AU - Chen, F. J. AU - Wu, Q. P. AU - Lai, N. W. AU - Yuan, L. X. AU - Zhang, F. S. PY - 2010 DA - 2010// TI - Ideotype root architecture for efficient nitrogen acquisition by maize in intensive cropping systems JO - Sci China-Life Sci VL - 53 UR - https://doi.org/10.1007/s11427-010-4097-y DO - 10.1007/s11427-010-4097-y ID - Mi2010 ER - TY - JOUR AU - Qin, L. AU - Walk, T. C. AU - Han, P. AU - Chen, L. AU - Zhang, S. AU - Li, Y. AU - Hu, X. AU - Xie, L. AU - Yang, Y. AU - Liu, J. AU - Lu, X. AU - Yu, C. AU - Tian, J. AU - Shaff, J. E. AU - Kochian, L. V. AU - Liao, X. AU - Liao, H. PY - 2019 DA - 2019// TI - Adaption of roots to nitrogen deficiency revealed by 3D quantification and proteomic analysis JO - Plant Physiol VL - 179 UR - https://doi.org/10.1104/pp.18.00716 DO - 10.1104/pp.18.00716 ID - Qin2019 ER - TY - JOUR AU - Saengwilai, P. AU - Tian, X. AU - Lynch, J. P. PY - 2014 DA - 2014// TI - Low crown root number enhances nitrogen acquisition from low-nitrogen soils in maize JO - Plant Physiol VL - 166 UR - https://doi.org/10.1104/pp.113.232603 DO - 10.1104/pp.113.232603 ID - Saengwilai2014 ER - TY - JOUR AU - Subodh, S. AU - Amitha, S. V. AU - Saurabh, C. AU - Punit, T. AU - Sureshkumar, V. AU - Manju, R. AU - Pranab, M. PY - 2018 DA - 2018// TI - Transcriptome analysis of two Rice varieties contrasting for nitrogen use efficiency under chronic N starvation reveals differences in chloroplast and starch metabolism-related genes JO - Genes VL - 9 UR - https://doi.org/10.3390/genes9040206 DO - 10.3390/genes9040206 ID - Subodh2018 ER - TY - JOUR AU - Sun, H. Y. AU - Qian, Q. AU - Wu, K. AU - Luo, J. J. AU - Wang, S. S. AU - Zhang, C. W. AU - Ma, Y. F. AU - Liu, Q. AU - Huang, X. Z. AU - Yuan, Q. B. AU - Han, R. X. AU - Zhao, M. AU - Dong, G. J. AU - Guo, L. B. AU - Zhu, X. D. AU - Gou, Z. H. AU - Wang, W. AU - Wu, Y. J. AU - Lin, H. X. AU - Fu, X. D. PY - 2014 DA - 2014// TI - Heterotrimeric G proteins regulate nitrogen-use efficiency in rice JO - Nat Genet VL - 46 UR - https://doi.org/10.1038/ng.2958 DO - 10.1038/ng.2958 ID - Sun2014 ER - TY - JOUR AU - Tabuchi, M. AU - Sugiyama, K. AU - Ishiyama, K. AU - Inoue, E. AU - Sato, T. AU - Takahashi, H. AU - Yamaya, T. PY - 2005 DA - 2005// TI - Severe reduction in growth rate and grain filling of rice mutants lacking osgs1;1, a cytosolic glutamine synthetase1;1 JO - Plant J VL - 42 UR - https://doi.org/10.1111/j.1365-313X.2005.02406.x DO - 10.1111/j.1365-313X.2005.02406.x ID - Tabuchi2005 ER - TY - JOUR AU - Tian, D. AU - Yang, L. AU - Chen, Z. AU - Chen, Z. AU - Wang, F. AU - Zhou, Y. AU - Luo, Y. AU - Yang, L. AU - Chen, S. PY - 2018 DA - 2018// TI - Proteomic analysis of the defense response to Magnaporthe oryzae in rice harboring the blast resistance gene Piz-t JO - Rice VL - 11 UR - https://doi.org/10.1186/s12284-018-0240-3 DO - 10.1186/s12284-018-0240-3 ID - Tian2018 ER - TY - JOUR AU - Tian, L. AU - Shi, S. AU - Nasir, F. AU - Chang, C. AU - Li, W. AU - Tran, L. S. P. AU - Tian, C. PY - 2018 DA - 2018// TI - Comparative analysis of the root transcriptomes of cultivated and wild rice varieties in response to Magnaporthe oryzae infection revealed both common and species-specific pathogen responses JO - Rice VL - 11 UR - https://doi.org/10.1186/s12284-018-0211-8 DO - 10.1186/s12284-018-0211-8 ID - Tian2018 ER - TY - JOUR AU - Turek, I. AU - Wheeler, J. I. AU - Gehring, C. AU - Irving, H. R. AU - Marondedze, C. PY - 2015 DA - 2015// TI - Quantitative proteome changes in Arabidopsis thaliana suspensioncultured cells in response to plant natriuretic peptides JO - Data in Brief VL - 4 UR - https://doi.org/10.1016/j.dib.2015.06.013 DO - 10.1016/j.dib.2015.06.013 ID - Turek2015 ER - TY - JOUR AU - Walch-liu, P. PY - 2006 DA - 2006// TI - Nitrogen regulation of root branching JO - Ann Bot VL - 97 UR - https://doi.org/10.1093/aob/mcj601 DO - 10.1093/aob/mcj601 ID - Walch-liu2006 ER - TY - JOUR AU - Wang, J. AU - Song, K. AU - Sun, L. AU - Qin, Q. AU - Sun, Y. AU - Pan, J. AU - Xue, Y. PY - 2019 DA - 2019// TI - Morphological and Transcriptome analysis of wheat seedlings response to low nitrogen stress JO - Plants VL - 8 UR - https://doi.org/10.3390/plants8040098 DO - 10.3390/plants8040098 ID - Wang2019 ER - TY - JOUR AU - Wang, X. C. AU - Chang, L. L. AU - Tong, Z. AU - Wang, D. Y. AU - Yin, Q. AU - Wang, D. AU - Jin, X. AU - Yang, Q. AU - Wang, L. M. AU - Sun, Y. AU - Huang, Q. X. AU - Guo, A. P. AU - Peng, M. PY - 2016 DA - 2016// TI - Proteomics profiling reveals carbohydrate metabolic enzymes and 14-3-3 proteins play important roles for starch accumulation during cassava root tuberization JO - Sci Rep-UK VL - 6 UR - https://doi.org/10.1038/srep19643 DO - 10.1038/srep19643 ID - Wang2016 ER - TY - JOUR AU - Wang, Z. Q. AU - Xu, X. Y. AU - Gong, Q. Q. AU - Xie, C. AU - Fan, W. AU - Yang, J. L. AU - Lin, Q. S. AU - Zheng, S. J. PY - 2014 DA - 2014// TI - Root proteome of rice studied by iTRAQ provides integrated insight into aluminum stress tolerance mechanisms in plants JO - J Proteome VL - 98 UR - https://doi.org/10.1016/j.jprot.2013.12.023 DO - 10.1016/j.jprot.2013.12.023 ID - Wang2014 ER - TY - JOUR AU - Wasteneys, G. O. AU - Yang, Z. PY - 2004 DA - 2004// TI - New views on the plant cytoskeleton JO - Plant Physiol VL - 136 UR - https://doi.org/10.1104/pp.104.900133 DO - 10.1104/pp.104.900133 ID - Wasteneys2004 ER - TY - JOUR AU - Wu, W. M. AU - Cheng, S. H. PY - 2014 DA - 2014// TI - Root genetic research, an opportunity and challenge to rice improvement JO - Field Crops Res VL - 165 UR - https://doi.org/10.1016/j.fcr.2014.04.013 DO - 10.1016/j.fcr.2014.04.013 ID - Wu2014 ER - TY - JOUR AU - Xin, W. AU - Zhang, L. AU - Zhang, W. AU - Gao, J. AU - Yi, J. AU - Zhen, X. AU - Du, M. AU - Zhao, Y. AU - Cheng, L. PY - 2019 DA - 2019// TI - An integrated analysis of the Rice Transcriptome and Metabolome reveals root growth regulation mechanisms in response to nitrogen availability JO - Int J Mol Sci VL - 20 UR - https://doi.org/10.3390/ijms20235893 DO - 10.3390/ijms20235893 ID - Xin2019 ER - TY - JOUR AU - Xin, W. AU - Zhang, L. AU - Zhang, W. AU - Gao, J. AU - Yi, J. AU - Zhen, X. AU - Li, Z. AU - Zhao, Y. AU - Peng, C. AU - Zhao, C. PY - 2019 DA - 2019// TI - An integrated analysis of the Rice Transcriptome and Metabolome reveals differential regulation of carbon and nitrogen metabolism in response to nitrogen availability JO - Int J Mol Sci VL - 20 UR - https://doi.org/10.3390/ijms20092349 DO - 10.3390/ijms20092349 ID - Xin2019 ER - TY - JOUR AU - Xu, G. AU - Fan, X. AU - Miller, A. J. PY - 2012 DA - 2012// TI - Plant nitrogen assimilation and use efficiency JO - Annu Rev Plant Biol VL - 63 UR - https://doi.org/10.1146/annurev-arplant-042811-105532 DO - 10.1146/annurev-arplant-042811-105532 ID - Xu2012 ER - TY - JOUR AU - Yang, W. AU - Yoon, J. AU - Choi, H. AU - Fan, Y. AU - Chen, R. AU - An, G. PY - 2015 DA - 2015// TI - Transcriptome analysis of nitrogen -starvation-responsive genes in rice JO - BMC Plant Biol VL - 15 UR - https://doi.org/10.1186/s12870-015-0425-5 DO - 10.1186/s12870-015-0425-5 ID - Yang2015 ER - TY - JOUR AU - Yang, X. AU - Nian, J. AU - Xie, Q. AU - Feng, J. AU - Zhang, F. AU - Jing, H. AU - Zhang, J. AU - Dong, G. AU - Liang, Y. AU - Peng, J. PY - 2016 DA - 2016// TI - Rice Ferredoxin-dependent glutamate synthase regulates nitrogen–carbon Metabolomes and is genetically differentiated between japonica and indica subspecies JO - Mol Plant VL - 9 UR - https://doi.org/10.1016/j.molp.2016.09.004 DO - 10.1016/j.molp.2016.09.004 ID - Yang2016 ER - TY - JOUR AU - Zhang, G. AU - Ye, J. AU - Jia, Y. AU - Zhang, L. AU - Song, X. PY - 2018 DA - 2018// TI - iTRAQ-based proteomics analyses of sterile/fertile anthers from a thermo-sensitive cytoplasmic male-sterile wheat with Aegilops kotschyi cytoplasm JO - Int J Mol Sci VL - 19 UR - https://doi.org/10.3390/ijms19051344 DO - 10.3390/ijms19051344 ID - Zhang2018 ER - TY - JOUR AU - Zhang, H. AU - Xue, Y. AU - Wang, Z. AU - Yang, J. AU - Zhang, J. PY - 2009 DA - 2009// TI - An alternate wetting and moderate soil drying regime improves root and shoot growth in rice JO - Crop Sci VL - 49 UR - https://doi.org/10.2135/cropsci2009.02.0099 DO - 10.2135/cropsci2009.02.0099 ID - Zhang2009 ER - TY - JOUR AU - Zhou, D. AU - Yang, Y. AU - Zhang, J. AU - Jiang, F. AU - Craft, E. AU - Thannhauser, T. W. AU - Kochian, L. V. AU - Liu, J. PY - 2017 DA - 2017// TI - Quantitative iTRAQ proteomics revealed possible roles for antioxidant proteins in sorghum aluminum tolerance JO - Front Plant Sci VL - 7 UR - https://doi.org/10.3389/fpls.2016.02043 DO - 10.3389/fpls.2016.02043 ID - Zhou2017 ER -