Skip to main content
Rice

Table 3 Significant affected transcription factor, TF, families during drought response

From: Transcriptome analysis of leaf and root of rice seedling to acute dehydration

 

Leaf

Root

0.5 h

 

2 h

 

6 h

 

12 h

 

0.5 h

 

2 h

 

6 h

 

12 h

 

U

D

C

U

D

C

U

D

C

U

D

C

U

D

C

U

D

C

U

D

C

U

D

C

Myb_DNA-binding

4

3

 

12

5

 

8

3

  

2

 

2

8

 

4

8

 

5

7

 

5

9

 

zf-C3HC4

 

3

  

2

 

11

3

 

9

2

    

2

6

 

3

8

 

3

  

NAM

 

4

 

11

   

2

 

13

3

  

8

 

5

5

 

6

5

 

6

5

 

HSF_DNA-binding

2

  

2

  

2

  

2

  

3

  

2

  

2

  

2

  

WRKY

  

2

3

  

2

  

2

   

4

   

2

 

3

 

2

3

 

K-box

   

3

  

2

          

2

  

2

  

2

CCT

 

2

  

2

 

2

3

 

2

2

    

2

  

2

  

2

  

F-box

 

4

 

3

2

 

2

  

2

   

2

 

2

  

2

    

2

NmrA

 

3

 

3

3

 

2

2

   

2

 

5

 

3

  

3

2

 

2

2

 

Homeobox

2

4

 

2

4

 

2

5

  

5

  

4

 

2

2

  

2

  

2

 

AP2

2

2

 

3

  

4

2

 

2

2

      

2

 

2

  

3

 

bZIP_1

 

2

       

3

       

2

  

2

   

SRF-TF

   

2

   

2

   

2

       

3

  

3

 

GRAS

     

2

 

2

  

2

  

2

  

3

  

3

  

2

 

Auxin_resp

    

3

  

3

  

3

  

3

        

3

 

mTERF

       

2

  

2

  

2

          

YL1

  

2

  

2

  

2

 

2

            

2

AUX_IAA

       

2

   

2

          

2

 

B3

        

2

  

2

            

MFMR

     

2

  

2

  

2

            

Sigma70_r2

    

3

  

3

  

3

             

PAZ

 

2

  

2

  

2

  

2

             

CDC50

 

2

                      

BAF1_ABF1

                    

2

  

2

TFIIA

             

3

  

3

  

3

  

3

 

E2F_TDP

             

2

  

2

  

2

  

2

 
  1. Total U, D and C TF in leaf are 171, 185, and 356; in root are 104, 212, and 316; respectively.
Back to article page