From: Transcriptome analysis of leaf and root of rice seedling to acute dehydration
Pathway | Leaf | Root | Â | |||||||||||||||||||||
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0.5Â h | Â | 2Â h | Â | 6Â h | Â | 12Â h | Â | 0.5Â h | Â | 2Â h | Â | 6Â h | Â | 12Â h | Â | |||||||||
U | D | C | U | D | C | U | D | C | U | D | C | U | D | C | U | D | C | U | D | C | U | D | C | |
Aerobic respiration | Â | 2 | Â | 2 | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | 3 | Â | Â | 2 | Â | Â | 4 | Â | Â | 5 | Â |
Gluconeogenesis | Â | 2 | Â | 2 | 2 | Â | 2 | 2 | Â | 2 | Â | Â | Â | 2 | Â | Â | 2 | Â | Â | 2 | Â | Â | 3 | Â |
De novo BS of pyrimidine ribonucleotides | Â | Â | Â | 2 | Â | Â | Â | 3 | Â | Â | 3 | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | 2 | Â | Â | 2 | Â |
Mevalonate pw | Â | Â | 2 | Â | Â | Â | 2 | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | 2 | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â |
Chorismate BS | Â | Â | Â | 2 | Â | Â | 2 | Â | Â | 2 | Â | Â | Â | 2 | Â | Â | 2 | Â | Â | 2 | Â | Â | 2 | Â |
Tryptophan BS | Â | Â | Â | Â | 2 | Â | 2 | 2 | Â | Â | 2 | Â | Â | Â | Â | Â | 2 | Â | Â | 2 | Â | Â | 2 | Â |
Photorespiration | Â | 2 | Â | Â | 3 | Â | Â | 3 | Â | Â | 3 | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | 2 | Â | Â | Â | Â | Â |
Brassinosteroid BS II | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | 2 | Â | Â | 2 | Â | Â | Â | 2 | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | 2 |
Cytokinins 7-N-glucoside BS | Â | Â | Â | Â | Â | 2 | Â | Â | 2 | Â | Â | 2 | 2 | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | 2 | Â | Â | 2 |
Carotenoid BS | Â | Â | Â | Â | 2 | Â | Â | 2 | Â | Â | Â | 2 | Â | Â | Â | 3 | Â | Â | 3 | Â | Â | 3 | Â | Â |
Starch degradation | Â | 2 | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | 2 | Â | Â | 2 | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | 2 | Â |
IAA BS I | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | 3 | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | 2 | Â |
Ascorbate glutathione cycle | Â | Â | 2 | Â | 2 | Â | Â | 3 | Â | Â | 3 | Â | Â | 2 | Â | Â | Â | Â | Â | Â | 2 | Â | 2 | Â |
Carbon monoxide dehydrogenase pw | Â | 7 | Â | Â | 6 | Â | Â | 9 | Â | Â | 9 | Â | Â | 2 | Â | Â | 2 | Â | Â | 4 | Â | Â | 6 | Â |
De novo BS of purine nucleotides I | Â | 4 | Â | Â | 4 | Â | Â | 6 | Â | Â | 8 | Â | Â | Â | Â | Â | 2 | Â | Â | 7 | Â | Â | 7 | Â |
dTDP-L-rhamnose BS | Â | 2 | Â | Â | Â | Â | Â | 2 | Â | Â | 2 | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | 2 | Â |
Phospholipid BS | Â | 3 | Â | Â | 2 | Â | Â | 2 | Â | Â | 2 | Â | Â | 2 | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | 2 | Â |
Sterol BS | Â | 2 | Â | Â | 2 | Â | Â | 2 | Â | Â | 2 | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | 2 | Â | Â | 2 | Â |
FormylTHF BS | Â | 2 | Â | Â | Â | Â | Â | 3 | Â | Â | 3 | Â | Â | 2 | Â | Â | Â | Â | Â | 2 | Â | Â | 3 | Â |
Glycine BS | Â | 2 | Â | Â | Â | 2 | Â | 2 | Â | Â | 2 | Â | Â | 2 | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | 2 |
Cysteine BS | Â | 2 | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | 3 | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | 2 | Â |
Glycine degradation | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | 2 | Â | Â | 2 | Â | Â | Â | Â | Â | 2 | Â | Â | 2 | Â | Â | 2 | Â |
Tetrahydrofolate BS II | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | 2 | Â | Â | 2 | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | 2 | Â | Â | 2 |
Triacylglycerol degradation | Â | 2 | Â | Â | 6 | Â | Â | 6 | Â | Â | 6 | Â | Â | 3 | Â | Â | Â | 2 | Â | Â | 2 | Â | 3 | Â |
tRNA charging pw | Â | 4 | Â | Â | 3 | Â | Â | 5 | Â | Â | 5 | Â | Â | 2 | Â | Â | Â | Â | Â | 2 | Â | Â | 6 | Â |
Dolichyl-diphosphooligosaccharide biosyn | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | 2 | Â | Â | 2 | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â |
Chlorophyll BS | Â | 2 | Â | Â | 2 | Â | Â | 6 | Â | Â | 6 | Â | Â | 3 | Â | Â | 3 | Â | Â | 5 | Â | Â | 6 | Â |
Lignin BS | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | 2 | Â | Â | 2 | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | 4 | Â | Â | 4 | Â |
GDP-D-rhamnose BS | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | 2 | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | 2 | Â | Â | 3 | Â |
Choline BS III | Â | Â | Â | 3 | Â | Â | 2 | Â | Â | 2 | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â |
Trehalose BS | Â | Â | Â | 2 | Â | Â | 2 | Â | Â | 2 | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â |
Asparagine degradation I | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | 2 | Â | Â | 2 | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â |
Calvin cycle | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | 2 | Â | Â | Â | 2 | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â |
Fatty acid elongation _ saturated | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | 2 | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â |
Glycolipid BS | Â | Â | Â | Â | Â | 2 | Â | Â | Â | Â | Â | 2 | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â |
Lysine BS | Â | Â | Â | Â | 2 | Â | Â | 2 | Â | Â | 2 | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â |
Pantothenate BS | Â | Â | Â | Â | 2 | Â | Â | 4 | Â | Â | 3 | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â |
Threonine degradation | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | 2 | Â | Â | 2 | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â |
Cellulose BS | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | 3 | Â | Â | 3 | Â | Â | 2 | Â |
De novo BS of pyrimidine ribonucleotides | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | 2 | Â | Â | 2 | Â |
Fatty acid BS _ initial steps | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | 2 | Â | Â | 2 | Â | Â | 2 | Â |
Homoserine BS | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | 2 | Â | Â | 2 | Â |
Isopentenyl diphosphate BS _ mevalonate-independent | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | 2 | Â |
Jasmonic acid BS | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | 2 | Â | Â | Â |
Riboflavin and FMN and FAD BS | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | 2 | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â |
Ribose degradation | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | 2 |